Từ khi thiết lập quan hệ ngoại giao Việt Nam – Nhật Bản ngày 21/09/1973, mối quan hệ hợp tác giữa hai nước không ngừng được mở rộng và phát triển nhanh chóng đạt được nhiều thành tựu đặc biệt là trong lĩnh vực khoa học và công nghệ. “Hiệp định Chính phủ về hợp tác Khoa học và Công nghệ Việt Nam - Nhật Bản” đã được ký vào tháng 8/2006, tạo môi trường thuận lợi cho các tổ chức khoa học và công nghệ, các nhà khoa học đẩy mạnh hợp tác thông qua việc trao đổi, chia sẻ thông tin, tạo bước phát triển mới để tăng cường hoạt động hợp tác về khoa học và công nghệ. Hai nước đã tổ chức 4 khóa họp “Uỷ ban Hỗn hợp về hợp tác Khoa học và Công nghệ” để thảo luận các lĩnh vực hợp tác nhằm thúc đẩy hợp tác song phương về khoa học và công nghệ ngày càng phát triển một cách sâu rộng. Hợp tác về Khoa học – Công nghệ giữa Việt Nam với Nhật Bản những năm qua được triển khai trên nhiều bình diện đồng thời thực hiện có hiệu quả các dự án nghiên cứu